Χημεία Τροφίμων
Οργανική Σύνθεση και Εφαρμογές της στη Χημική Βιομηχανία
Κατάλυση και Εφαρμογές της στη Βιομηχανία
Φυσικοχημεία
Διδακτική της Χημείας, Νέες Εκπαιδευτικές Τεχνολογίες και Εκπαίδευση για την Αειφόρο Ανάπτυξη (ΔιΧηΝΕΤ-ΕΑΑ)
Αναλυτική Χημεία – Διασφάλιση Ποιότητας
Αμπελουργία – Οινολογία και Αλκοολούχα Ποτά
Επιστήμη Πολυμερών και Εφαρμογές της στη Βιομηχανία
Ανόργανη Χημεία και Εφαρμογές της στη Βιομηχανία
Το Τμήμα Χημείας συμμετέχει και στα ακόλουθα Διατμηματικά και Διιδρυματικά και Διακρατικά ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ ΣΠΟΥΔΩΝ, των οποίων δεν έχει την διοικητική ευθύνη.